44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2720 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009939  Dgeo_2989  transposase IS4 family protein  100 
 
 
331 aa  672    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2932  transposase IS4 family protein  100 
 
 
331 aa  672    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2720  transposase, IS4  100 
 
 
331 aa  672    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828953  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2834  transposase, IS4  100 
 
 
331 aa  672    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0452405  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2912  transposase IS4 family protein  100 
 
 
331 aa  672    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2910  transposase, IS4  100 
 
 
175 aa  309  4e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0038  hypothetical protein  35.56 
 
 
361 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1851  hypothetical protein  35.28 
 
 
361 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0716  hypothetical protein  35.58 
 
 
361 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0881  hypothetical protein  35.58 
 
 
361 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1813  hypothetical protein  35.58 
 
 
361 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1945  hypothetical protein  35.58 
 
 
361 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2895  hypothetical protein  35.58 
 
 
361 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2440  transposase, IS4  35 
 
 
352 aa  172  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1784  transposase, IS4  35 
 
 
352 aa  172  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0446  transposase IS4 family protein  32.67 
 
 
354 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.449518 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5377  transposase IS4 family protein  35.74 
 
 
354 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.302051 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2052  hypothetical protein  38.71 
 
 
261 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2594  hypothetical protein  36.03 
 
 
219 aa  89.7  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00339974  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5057  hypothetical protein  41.18 
 
 
183 aa  85.9  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00408513  normal  0.218379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2039  transposase IS4 family protein  25.26 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0330  hypothetical protein  41.98 
 
 
104 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0444  transposase, IS4 family protein  26.86 
 
 
372 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000119461  normal  0.0439577 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5389  transposase IS4 family protein  27.93 
 
 
387 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5516  transposase IS4 family protein  27.93 
 
 
387 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.378571 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4552  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
384 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3922  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
384 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3398  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
384 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3046  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
384 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2792  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
384 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2048  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
384 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1809  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
384 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1100  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
384 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4536  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
384 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0600651  normal  0.65428 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4514  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
384 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.810745  normal  0.887559 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4499  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
384 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4489  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
384 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4464  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
384 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4535  transposase IS4 family protein  26.34 
 
 
365 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3880  hypothetical protein  31.82 
 
 
144 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0189214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0411  transposase IS4 family protein  25.78 
 
 
383 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.215728  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0405  transposase IS4 family protein  25.78 
 
 
383 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00559123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1056  hypothetical protein  36.21 
 
 
66 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0265402 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1477  hypothetical protein  33.85 
 
 
77 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.64011  normal  0.251804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>