10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0542 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0542  putative transposase  100 
 
 		 56 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0783081  normal  0.222034 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1101  insertion element protein  76.36 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5203  Insertion element protein  46.43 
 
 		 230 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.32414e-16 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5744  Insertion element protein  46.43 
 
 		 230 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1208  Insertion element protein  46.43 
 
 		 230 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2516  Insertion element protein  46.43 
 
 		 230 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3201  insertion element protein  37.5 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0438746  normal  0.11572 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0795  IS1 transposase  50 
 
 		 321 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1598  IS1 transposase  50 
 
 		 316 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1282  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  40.4  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.147324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>