23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1375 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1375  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  179  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1813  hypothetical protein  40.74 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0868  hypothetical protein  32.91 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101453 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2546  hypothetical protein  27.27 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666952  normal  0.103184 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2616  hypothetical protein  34.18 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00109399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2122  hypothetical protein  26.97 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0754544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0967  hypothetical protein  33.33 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.284215  normal  0.586878 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11910  hypothetical protein  30.38 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.493836  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0724  hypothetical protein  32 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3381  hypothetical protein  54.29 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0825  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.866188  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1112  hypothetical protein  48.57 
 
 		 72 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.220285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3290  hypothetical protein  27.5 
 
 		 81 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0343638  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0660  hypothetical protein  28.92 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60240  hypothetical protein  35.23 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100912 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3628  hypothetical protein  25 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.762255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2938  hypothetical protein  25 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.453389  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2945  hypothetical protein  32.97 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.875889  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3270  hypothetical protein  45.95 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2512  hypothetical protein  45.95 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1293  hypothetical protein  45.95 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0434  hypothetical protein  45.95 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635007  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3513  hypothetical protein  45.95 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>