25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0495 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0495  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  352  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0957  hypothetical protein  79.86 
 
 
159 aa  243  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46128  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0696  hypothetical protein  72.66 
 
 
161 aa  223  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2912  hypothetical protein  58.74 
 
 
173 aa  194  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4337  Protein of unknown function DUF2596  60.31 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4608  Protein of unknown function DUF2596  53.37 
 
 
177 aa  177  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0332  hypothetical protein  55.86 
 
 
190 aa  171  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6756  hypothetical protein  54.55 
 
 
165 aa  168  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02660  Protein of unknown function (DUF2596)  48.5 
 
 
181 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0455  hypothetical protein  51.59 
 
 
164 aa  164  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4049  hypothetical protein  58.27 
 
 
199 aa  164  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8223  hypothetical protein  49.08 
 
 
182 aa  164  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6163  hypothetical protein  50.66 
 
 
164 aa  161  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5954  hypothetical protein  52.17 
 
 
159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0828  hypothetical protein  47.77 
 
 
176 aa  151  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193703  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0085  hypothetical protein  46.98 
 
 
169 aa  147  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0651  hypothetical protein  55.74 
 
 
177 aa  147  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0658  hypothetical protein  55.74 
 
 
177 aa  147  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0671  hypothetical protein  55.74 
 
 
177 aa  147  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.758778  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0399  hypothetical protein  51.49 
 
 
184 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366616  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10495  hypothetical protein  50 
 
 
183 aa  138  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000885199  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4934  hypothetical protein  42.57 
 
 
159 aa  137  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0990  Protein of unknown function DUF2596  42.95 
 
 
196 aa  136  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03660  Protein of unknown function (DUF2596)  41.54 
 
 
201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.861967  normal  0.289484 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0628  Protein of unknown function DUF2596  45.45 
 
 
170 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>