25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0455 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0455  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6163  hypothetical protein  83.44 
 
 		 164 aa  282  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0495  hypothetical protein  51.59 
 
 		 173 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0696  hypothetical protein  54.74 
 
 		 161 aa  164  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0957  hypothetical protein  57.66 
 
 		 159 aa  164  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2912  hypothetical protein  46.62 
 
 		 173 aa  150  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4608  Protein of unknown function DUF2596  49.29 
 
 		 177 aa  140  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5954  hypothetical protein  50 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6756  hypothetical protein  50.68 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02660  Protein of unknown function (DUF2596)  47.33 
 
 		 181 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0332  hypothetical protein  46.15 
 
 		 190 aa  133  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4337  Protein of unknown function DUF2596  51.22 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0828  hypothetical protein  44.29 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193703  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0651  hypothetical protein  42.21 
 
 		 177 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0671  hypothetical protein  42.21 
 
 		 177 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.758778  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0658  hypothetical protein  42.21 
 
 		 177 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0399  hypothetical protein  45.52 
 
 		 184 aa  120  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366616  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4049  hypothetical protein  46.67 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8223  hypothetical protein  43.94 
 
 		 182 aa  117  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0085  hypothetical protein  42.86 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4934  hypothetical protein  40.43 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10495  hypothetical protein  42.58 
 
 		 183 aa  103  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000885199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0990  Protein of unknown function DUF2596  40.34 
 
 		 196 aa  100  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0628  Protein of unknown function DUF2596  47.06 
 
 		 170 aa  88.6  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03660  Protein of unknown function (DUF2596)  38.14 
 
 		 201 aa  85.1  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.861967  normal  0.289484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>