16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1315 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1315  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  688    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.147892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2313  hypothetical protein  31.2 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.339501  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2765  hypothetical protein  31.13 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.565158  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3421  hypothetical protein  30.28 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1664  hypothetical protein  30.77 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0908123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4953  hypothetical protein  36.17 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2597  phage replication protein  27.45 
 
 		 248 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0867  hypothetical protein  30.43 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0884  phi ETA orf 22-like protein  30.43 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1507  phage replication protein  25 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0584377 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3828  prophage LambdaBa02, DNA replication protein  29.47 
 
 		 238 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4121  prophage LambdaBa02, DNA replication protein  29.47 
 
 		 238 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0813  primosome, DnaD subunit  29.47 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1137  primosome, DnaD subunit  29.47 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2127  hypothetical protein  37.25 
 
 		 196 aa  43.9  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3615  hypothetical protein  30 
 
 		 300 aa  43.5  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>