17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0813 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0813  primosome, DnaD subunit  100 
 
 
285 aa  593  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1137  primosome, DnaD subunit  100 
 
 
285 aa  593  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2597  phage replication protein  35.53 
 
 
248 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1507  phage replication protein  30.2 
 
 
295 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0584377 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4121  prophage LambdaBa02, DNA replication protein  31.23 
 
 
238 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3828  prophage LambdaBa02, DNA replication protein  31.23 
 
 
238 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19717  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2127  hypothetical protein  32.26 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0884  phi ETA orf 22-like protein  37.96 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0867  hypothetical protein  37.96 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2313  hypothetical protein  28.4 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.339501  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1664  hypothetical protein  26.62 
 
 
417 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0908123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4953  hypothetical protein  30.61 
 
 
237 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195742  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2765  hypothetical protein  30.11 
 
 
488 aa  58.9  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.565158  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3421  hypothetical protein  30.11 
 
 
484 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2725  primosome, DnaD subunit  27.35 
 
 
354 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00361289  hitchhiker  0.000707031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8591  hypothetical protein  31.17 
 
 
287 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392615  normal  0.459198 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1315  hypothetical protein  29.47 
 
 
332 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.147892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>