12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1566 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1566  PilT protein domain protein  100 
 
 		 126 aa  254  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1729  PilT protein-like  39.84 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5644  PilT protein domain protein  42.4 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2840  PilT protein-like  38.4 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4672  PilT protein-like  36.29 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3354  PilT protein domain protein  43.86 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.593845  normal  0.0124414 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3972  PilT domain-containing protein  34.62 
 
 		 129 aa  52.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2593  PilT protein-like protein  32.69 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3323  hypothetical protein  25.69 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0195  PilT protein-like  29.85 
 
 		 146 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  24.43 
 
 		 137 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6313  PilT protein domain protein  25 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>