39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE_tRNA-Gln-1 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000064981  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0014  tRNA-Gln  87.67 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.349887  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0019  tRNA-Gln  88.71 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349932  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0011  tRNA-Gln  86.3 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0815  tRNA-Gln  86.3 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.0000000161826  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0020  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000533123  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0021  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlnVIMSS1309367  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0047  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0048  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.807187  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlnVIMSS1309175  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlnVIMSS1309278  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlnVIMSS1309214  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlnVIMSS1309134  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.500846  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlnVIMSS1309102  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0018  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0047  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00177856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0022  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.310652  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0008  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.825941  normal  0.0317691 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0039  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.588412  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0047  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.907945  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0037  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0225857  normal  0.764291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0064  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0022  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0069  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476746  normal  0.206288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0074  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.181678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0048  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0051  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00516636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0052  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00572206  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0046  tRNA-Gln  85.48 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0023  tRNA-Gln  88 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00187779  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0017  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0205795  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1775  tRNA-Gln  86.21 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000331102  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1769  tRNA-Gln  86.21 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157848  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1766  tRNA-Gln  86.21 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000182708  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  85.48 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  85.48 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  85.48 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  85.48 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>