18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1638 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1638  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  176  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.634391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1229  hypothetical protein  48.86 
 
 
88 aa  100  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0885472  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01391  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.440873 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26451  hypothetical protein  54.76 
 
 
87 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1959  hypothetical protein  51.81 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1986  hypothetical protein  50.6 
 
 
89 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000656198  normal  0.027281 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1952a  hypothetical protein  49.41 
 
 
87 aa  92.8  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.112764  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2376  hypothetical protein  50 
 
 
110 aa  92.8  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.346723  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01981  hypothetical protein  49.41 
 
 
86 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1492  hypothetical protein  48.24 
 
 
86 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2513  hypothetical protein  47.78 
 
 
90 aa  88.2  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000722203  normal  0.0972168 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3777  hypothetical protein  47.62 
 
 
90 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000616585  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3819  hypothetical protein  49.4 
 
 
88 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2975  hypothetical protein  42.05 
 
 
89 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01381  hypothetical protein  37.93 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.32673  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01421  hypothetical protein  37.93 
 
 
92 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.789406  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0127  hypothetical protein  38.2 
 
 
90 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.218025  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01411  hypothetical protein  37.93 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.537769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>