18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1952a on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1952a  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  175  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.112764  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2376  hypothetical protein  81.61 
 
 
110 aa  150  8e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.346723  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26451  hypothetical protein  65.52 
 
 
87 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01391  hypothetical protein  54.65 
 
 
87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.440873 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01981  hypothetical protein  56.32 
 
 
86 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1492  hypothetical protein  56.32 
 
 
86 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01381  hypothetical protein  46.59 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.32673  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01411  hypothetical protein  46.59 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.537769  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01421  hypothetical protein  46.59 
 
 
92 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.789406  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0127  hypothetical protein  45.45 
 
 
90 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.218025  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1229  hypothetical protein  43.37 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0885472  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1638  hypothetical protein  49.41 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.634391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1959  hypothetical protein  48.19 
 
 
89 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1986  hypothetical protein  48.19 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000656198  normal  0.027281 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3777  hypothetical protein  42.86 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000616585  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2975  hypothetical protein  47.22 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3819  hypothetical protein  44.58 
 
 
88 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2513  hypothetical protein  41.67 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000722203  normal  0.0972168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>