21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0880 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0880  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  371  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102251 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0666  hypothetical protein  42.53 
 
 
195 aa  144  8.000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4404  hypothetical protein  42.94 
 
 
198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1283  hypothetical protein  40.8 
 
 
195 aa  137  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000409611  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0045  hypothetical protein  40.57 
 
 
190 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1095  hypothetical protein  36.99 
 
 
198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1066  hypothetical protein  36.99 
 
 
198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0479  hypothetical protein  39.2 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27619  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2027  hypothetical protein  39.29 
 
 
177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.725628  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16261  hypothetical protein  35.29 
 
 
177 aa  107  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16831  hypothetical protein  34.71 
 
 
172 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0315  hypothetical protein  36.47 
 
 
191 aa  104  9e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23701  hypothetical protein  35.43 
 
 
194 aa  101  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105935 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19441  hypothetical protein  36.47 
 
 
170 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1595  hypothetical protein  33.14 
 
 
172 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1069  hypothetical protein  36.47 
 
 
170 aa  98.6  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.604452  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16941  hypothetical protein  33.14 
 
 
172 aa  98.6  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17061  hypothetical protein  34.3 
 
 
172 aa  98.6  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.960892  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0629  hypothetical protein  25 
 
 
171 aa  51.2  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.784983  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49892  predicted protein  23.57 
 
 
267 aa  50.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254888  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2040  hypothetical protein  24.4 
 
 
182 aa  45.1  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>