20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2027 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2027  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  354  2.9999999999999997e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.725628  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0315  hypothetical protein  77.38 
 
 
191 aa  265  2e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16261  hypothetical protein  60.71 
 
 
177 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19441  hypothetical protein  57.74 
 
 
170 aa  201  6e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1069  hypothetical protein  57.74 
 
 
170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.604452  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23701  hypothetical protein  56.73 
 
 
194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105935 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1595  hypothetical protein  52.69 
 
 
172 aa  184  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16941  hypothetical protein  52.69 
 
 
172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17061  hypothetical protein  52.98 
 
 
172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.960892  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16831  hypothetical protein  53.29 
 
 
172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0880  hypothetical protein  39.29 
 
 
185 aa  114  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102251 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0666  hypothetical protein  30.06 
 
 
195 aa  90.1  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1283  hypothetical protein  29.48 
 
 
195 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000409611  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1095  hypothetical protein  29.44 
 
 
198 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1066  hypothetical protein  29.89 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4404  hypothetical protein  30.73 
 
 
198 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0479  hypothetical protein  31.61 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27619  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0045  hypothetical protein  26.44 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0629  hypothetical protein  26.75 
 
 
171 aa  58.2  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.784983  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2040  hypothetical protein  25.83 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>