18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0398 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0398  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  305  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3374  hypothetical protein  73.1 
 
 
154 aa  219  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198947  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2152  hypothetical protein  65.13 
 
 
157 aa  208  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748779 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4315  hypothetical protein  64.9 
 
 
156 aa  206  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228058  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2501  hypothetical protein  62.91 
 
 
157 aa  201  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3613  hypothetical protein  62.91 
 
 
157 aa  201  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3698  hypothetical protein  64.47 
 
 
156 aa  200  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.383291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0244  hypothetical protein  55.26 
 
 
152 aa  176  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0273  hypothetical protein  55.41 
 
 
152 aa  174  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1001  hypothetical protein  60.26 
 
 
155 aa  170  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.964836 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13920  predicted protein  38.79 
 
 
214 aa  101  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000864813  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16334  predicted protein  33.33 
 
 
223 aa  93.2  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0892658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1975  hypothetical protein  29.71 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000807179  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2792  hypothetical protein  32.23 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1260  hypothetical protein  40.35 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1767  hypothetical protein  28.57 
 
 
161 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1795  hypothetical protein  28.57 
 
 
161 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00250002  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1569  hypothetical protein  31.76 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.201049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>