12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1260 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1260  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  290  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2792  hypothetical protein  68.63 
 
 
153 aa  180  8.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1569  hypothetical protein  59.09 
 
 
145 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.201049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0638  hypothetical protein  59.09 
 
 
145 aa  135  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00168546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2068  hypothetical protein  59.09 
 
 
145 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2092  hypothetical protein  58.44 
 
 
145 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.532572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0834  hypothetical protein  63.77 
 
 
129 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.210855 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0398  hypothetical protein  36.05 
 
 
152 aa  48.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4315  hypothetical protein  30.23 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228058  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3613  hypothetical protein  36.36 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2501  hypothetical protein  36.36 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3374  hypothetical protein  36.36 
 
 
154 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198947  normal  0.753058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>