20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2018 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2018  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  280  3.0000000000000004e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0324  hypothetical protein  84.11 
 
 
108 aa  187  5e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.746264  normal  0.641736 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1284  putative AIR synthase related protein  53.33 
 
 
116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21561  hypothetical protein  53.33 
 
 
116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.83434 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18131  hypothetical protein  46.73 
 
 
117 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18931  hypothetical protein  44.14 
 
 
128 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29351  AIR synthase related protein  54.37 
 
 
116 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1776  hypothetical protein  43.24 
 
 
128 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.124462  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18741  hypothetical protein  44.25 
 
 
128 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0695163  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18741  hypothetical protein  44.76 
 
 
112 aa  98.2  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0053  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.78 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1291  HesB/YadR/YfhF  26.92 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0112575  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1540  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  28.57 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1565  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  28.3 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548609  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0658  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  27.88 
 
 
110 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.393107  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3912  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  27.62 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0472  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  26.67 
 
 
107 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.3 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3829  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  28.3 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  28.57 
 
 
206 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>