21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1872 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1872  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  182  9e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0464  hypothetical protein  79.55 
 
 
91 aa  149  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22201  hypothetical protein  68.54 
 
 
91 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1685  hypothetical protein  48.86 
 
 
89 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11751  hypothetical protein  53.41 
 
 
89 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.14974 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03981  hypothetical protein  46.59 
 
 
89 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2403  hypothetical protein  59.77 
 
 
94 aa  91.3  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000123081  hitchhiker  0.00255204 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0522  hypothetical protein  47.67 
 
 
92 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3307  hypothetical protein  45.35 
 
 
94 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309408  normal  0.996531 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4031  hypothetical protein  42.86 
 
 
92 aa  83.6  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4069  hypothetical protein  41.76 
 
 
92 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114085  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10951  hypothetical protein  35.37 
 
 
84 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.296229  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10991  hypothetical protein  34.94 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.59885  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10991  hypothetical protein  34.94 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1020  hypothetical protein  35.37 
 
 
84 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.118238  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0224  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.85 
 
 
260 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.011733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1085  hypothetical protein  30.68 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.870984  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13022  predicted protein  30.59 
 
 
276 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.197262  normal  0.0448827 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0652  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  32.08 
 
 
283 aa  40.8  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00637649  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00466  integral membrane protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04315)  33.77 
 
 
222 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5432  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.88 
 
 
260 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.932188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>