22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0464 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0464  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  185  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1872  hypothetical protein  79.55 
 
 
89 aa  149  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22201  hypothetical protein  67.05 
 
 
91 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11751  hypothetical protein  50 
 
 
89 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.14974 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1685  hypothetical protein  48.86 
 
 
89 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03981  hypothetical protein  46.59 
 
 
89 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0522  hypothetical protein  48.84 
 
 
92 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3307  hypothetical protein  47.67 
 
 
94 aa  87  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309408  normal  0.996531 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2403  hypothetical protein  56.32 
 
 
94 aa  85.5  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000123081  hitchhiker  0.00255204 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4069  hypothetical protein  43.02 
 
 
92 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114085  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4031  hypothetical protein  43.02 
 
 
92 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10951  hypothetical protein  35.37 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.296229  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10991  hypothetical protein  33.73 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10991  hypothetical protein  33.73 
 
 
89 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.59885  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1020  hypothetical protein  32.93 
 
 
84 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.118238  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1758  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  36 
 
 
248 aa  45.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0224  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.33 
 
 
260 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.011733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1085  hypothetical protein  30.68 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.870984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0917  hypothetical protein  32.14 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0078  hypothetical protein  31.4 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1358  hypothetical protein  30.12 
 
 
289 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0010611  normal  0.192229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4366  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.12 
 
 
243 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.809108  normal  0.082398 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>