25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2403 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2403  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  189  8e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000123081  hitchhiker  0.00255204 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0522  hypothetical protein  52.17 
 
 
92 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4031  hypothetical protein  48.91 
 
 
92 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4069  hypothetical protein  48.91 
 
 
92 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114085  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1872  hypothetical protein  59.77 
 
 
89 aa  101  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0464  hypothetical protein  56.32 
 
 
91 aa  97.4  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3307  hypothetical protein  45.65 
 
 
94 aa  90.9  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309408  normal  0.996531 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22201  hypothetical protein  50.55 
 
 
91 aa  90.5  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1685  hypothetical protein  42.53 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03981  hypothetical protein  41.38 
 
 
89 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11751  hypothetical protein  46.43 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.14974 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10951  hypothetical protein  31.33 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.296229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0917  hypothetical protein  31.52 
 
 
101 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0224  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.46 
 
 
260 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.011733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0078  hypothetical protein  47.73 
 
 
105 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5432  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.24 
 
 
260 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.932188  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10991  hypothetical protein  26.44 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2207  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  38.1 
 
 
251 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.359427  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1020  hypothetical protein  26.74 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.118238  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10991  hypothetical protein  25.29 
 
 
89 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.59885  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1085  hypothetical protein  42.22 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.870984  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4614  hypothetical protein  25 
 
 
97 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0603722  hitchhiker  0.0051241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3456  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  28.09 
 
 
268 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0587  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  32.56 
 
 
252 aa  40.8  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2844  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.68 
 
 
238 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.907911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>