19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1193 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1193  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0627158  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1284  hypothetical protein  78.52 
 
 
149 aa  263  8.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14241  hypothetical protein  79.87 
 
 
149 aa  258  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07801  hypothetical protein  67.35 
 
 
150 aa  233  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500233 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07241  hypothetical protein  64.63 
 
 
149 aa  232  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00369648 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0099  hypothetical protein  63.95 
 
 
149 aa  229  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07221  hypothetical protein  59.59 
 
 
147 aa  213  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07401  hypothetical protein  58.22 
 
 
147 aa  213  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0667  hypothetical protein  58.9 
 
 
147 aa  213  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0996316  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07201  hypothetical protein  58.22 
 
 
147 aa  211  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.182928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0006  hypothetical protein  52.03 
 
 
150 aa  180  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.755501  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2390  hypothetical protein  55.07 
 
 
152 aa  176  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0562  hypothetical protein  52.94 
 
 
151 aa  172  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.90761  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0617  hypothetical protein  50.34 
 
 
149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1684  hypothetical protein  51.8 
 
 
152 aa  171  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.829432  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2598  hypothetical protein  51.03 
 
 
147 aa  169  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3508  hypothetical protein  51.03 
 
 
147 aa  169  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.44463  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3749  hypothetical protein  48.65 
 
 
150 aa  169  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.411153 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9086  predicted protein  42.14 
 
 
141 aa  133  8e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>