19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0512 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0512  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 
77 aa  145  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.330068  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0967  preprotein translocase subunit SecG  76.32 
 
 
76 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18351  preprotein translocase subunit SecG  76.32 
 
 
76 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16141  preprotein translocase subunit SecG  75.68 
 
 
74 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1528  preprotein translocase subunit SecG  78.08 
 
 
75 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16251  preprotein translocase subunit SecG  78.08 
 
 
75 aa  97.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16371  preprotein translocase subunit SecG  73.97 
 
 
75 aa  97.1  8e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2165  preprotein translocase subunit SecG  88.16 
 
 
76 aa  85.5  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0371521  normal  0.111575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0724  preprotein translocase subunit SecG  55.26 
 
 
77 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.505164  normal  0.708301 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15531  preprotein translocase subunit SecG  80.26 
 
 
76 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2545  preprotein translocase subunit SecG  53.95 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0468  preprotein translocase subunit SecG  59.21 
 
 
79 aa  73.9  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05071  preprotein translocase subunit SecG  76.32 
 
 
76 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4039  preprotein translocase subunit SecG  52.63 
 
 
78 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707889 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2263  preprotein translocase subunit SecG  48.05 
 
 
79 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2314  preprotein translocase subunit SecG  48.05 
 
 
79 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.493273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2211  preprotein translocase subunit SecG  59.02 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00048645 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1010  preprotein translocase subunit SecG  58.93 
 
 
77 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419992  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0921  preprotein translocase, SecG subunit  36.49 
 
 
83 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.255471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>