18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2263 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2314  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 
79 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.493273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2263  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 
79 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2211  preprotein translocase subunit SecG  78.48 
 
 
79 aa  106  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00048645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0724  preprotein translocase subunit SecG  64 
 
 
77 aa  102  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.505164  normal  0.708301 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2545  preprotein translocase subunit SecG  65.33 
 
 
77 aa  99.8  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4039  preprotein translocase subunit SecG  61.04 
 
 
78 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707889 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0967  preprotein translocase subunit SecG  50.67 
 
 
76 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18351  preprotein translocase subunit SecG  50.67 
 
 
76 aa  78.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1010  preprotein translocase subunit SecG  72.15 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419992  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0468  preprotein translocase subunit SecG  68.06 
 
 
79 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16251  preprotein translocase subunit SecG  53.33 
 
 
75 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1528  preprotein translocase subunit SecG  52 
 
 
75 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16371  preprotein translocase subunit SecG  50.67 
 
 
75 aa  70.1  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16141  preprotein translocase subunit SecG  54.17 
 
 
74 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0512  preprotein translocase subunit SecG  42.86 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.330068  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15531  preprotein translocase subunit SecG  46.67 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2165  preprotein translocase subunit SecG  45.28 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0371521  normal  0.111575 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10170  protein translocase, SecG subunit  39.06 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000553201  hitchhiker  0.000000506561 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>