19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0724 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0724  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 
77 aa  148  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.505164  normal  0.708301 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2545  preprotein translocase subunit SecG  88.31 
 
 
77 aa  135  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4039  preprotein translocase subunit SecG  76.06 
 
 
78 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2211  preprotein translocase subunit SecG  69.33 
 
 
79 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00048645 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2314  preprotein translocase subunit SecG  64 
 
 
79 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.493273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2263  preprotein translocase subunit SecG  64 
 
 
79 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0967  preprotein translocase subunit SecG  59.7 
 
 
76 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18351  preprotein translocase subunit SecG  60.61 
 
 
76 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0468  preprotein translocase subunit SecG  69.86 
 
 
79 aa  77.4  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1010  preprotein translocase subunit SecG  77.59 
 
 
77 aa  77  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419992  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16251  preprotein translocase subunit SecG  53.52 
 
 
75 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16371  preprotein translocase subunit SecG  50.7 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1528  preprotein translocase subunit SecG  55.22 
 
 
75 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16141  preprotein translocase subunit SecG  48.65 
 
 
74 aa  60.1  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0512  preprotein translocase subunit SecG  50 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.330068  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15531  preprotein translocase subunit SecG  48.61 
 
 
76 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2165  preprotein translocase subunit SecG  50 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0371521  normal  0.111575 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10170  protein translocase, SecG subunit  46.55 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000553201  hitchhiker  0.000000506561 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0307  preprotein translocase subunit SecG  42.47 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>