18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4017 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4017  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  357  5e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3419  hypothetical protein  67.42 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.735509  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3458  hypothetical protein  60.34 
 
 		 179 aa  201  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1892  hypothetical protein  60.34 
 
 		 179 aa  201  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4272  hypothetical protein  57.46 
 
 		 180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4411  hypothetical protein  57.46 
 
 		 180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3838  hypothetical protein  57.54 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2282  hypothetical protein  36.08 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.445017  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0961  hypothetical protein  35.59 
 
 		 178 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2554  hypothetical protein  35.56 
 
 		 189 aa  92  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0146  hypothetical protein  34.44 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0196  hypothetical protein  28.9 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.114335  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4197  hypothetical protein  33.73 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3892  hypothetical protein  28.49 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0079  hypothetical protein  28.78 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4177  hypothetical protein  27.01 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3860  hypothetical protein  29.76 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.577525  normal  0.0161383 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06216  hypothetical protein  29.23 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>