16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4197 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4197  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  350  8e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3860  hypothetical protein  48.82 
 
 
178 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.577525  normal  0.0161383 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4017  hypothetical protein  33.73 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4272  hypothetical protein  30 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4411  hypothetical protein  30 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1892  hypothetical protein  34.46 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3458  hypothetical protein  34.46 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3838  hypothetical protein  28.57 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2282  hypothetical protein  25 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.445017  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2554  hypothetical protein  26.4 
 
 
189 aa  59.3  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3419  hypothetical protein  36.36 
 
 
178 aa  58.5  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.735509  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0079  hypothetical protein  36.25 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0146  hypothetical protein  25.84 
 
 
189 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0961  hypothetical protein  25.99 
 
 
178 aa  55.1  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0196  hypothetical protein  26.83 
 
 
175 aa  48.5  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.114335  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3892  hypothetical protein  18.79 
 
 
175 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>