18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1444 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1444  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  197  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.201338  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0580  hypothetical protein  75.23 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2089  hypothetical protein  70.64 
 
 
108 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000113072  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0600  membrane protein of unknown function  73.64 
 
 
115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2504  hypothetical protein  67.27 
 
 
110 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12870  hypothetical protein  65.14 
 
 
111 aa  140  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.06445e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2126  membrane protein of unknown function  61.11 
 
 
116 aa  124  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3258  membrane protein of unknown function  66.67 
 
 
112 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.812334  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2066  hypothetical protein  68.18 
 
 
119 aa  122  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1593  hypothetical protein  60.58 
 
 
108 aa  121  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000697441  unclonable  7.95944e-24 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0353  membrane protein of unknown function  55.96 
 
 
117 aa  114  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4314  membrane protein of unknown function  62.73 
 
 
110 aa  111  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181268  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2921  hypothetical protein  47.06 
 
 
122 aa  94  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.315702  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2597  hypothetical protein  46.08 
 
 
122 aa  94  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2067  hypothetical protein  45.78 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.106252  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2873  membrane protein of unknown function  41.58 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1458  hypothetical protein  26.17 
 
 
119 aa  51.2  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.293367  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  30.84 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.296215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>