17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2873 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2873  membrane protein of unknown function  100 
 
 
119 aa  227  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2067  hypothetical protein  58.04 
 
 
135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.106252  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2921  hypothetical protein  53.92 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.315702  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2597  hypothetical protein  52.94 
 
 
122 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0580  hypothetical protein  45.54 
 
 
112 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1593  hypothetical protein  42.16 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000697441  unclonable  7.95944e-24 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2126  membrane protein of unknown function  41.35 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2089  hypothetical protein  39.22 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000113072  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12870  hypothetical protein  39 
 
 
111 aa  76.6  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.06445e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2504  hypothetical protein  38.83 
 
 
110 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0353  membrane protein of unknown function  38.46 
 
 
117 aa  73.9  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0600  membrane protein of unknown function  40.18 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1444  hypothetical protein  44.58 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.201338  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4314  membrane protein of unknown function  42.86 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181268  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1458  hypothetical protein  29.31 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.293367  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2066  hypothetical protein  36.89 
 
 
119 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3258  membrane protein of unknown function  36.27 
 
 
112 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.812334  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>