17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2921 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2921  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  235  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.315702  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2597  hypothetical protein  98.36 
 
 
122 aa  233  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1593  hypothetical protein  55.45 
 
 
108 aa  108  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000697441  unclonable  7.95944e-24 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2089  hypothetical protein  46.73 
 
 
108 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000113072  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2067  hypothetical protein  52.33 
 
 
135 aa  99.4  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.106252  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0580  hypothetical protein  49.54 
 
 
112 aa  98.6  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12870  hypothetical protein  50 
 
 
111 aa  97.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.06445e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0353  membrane protein of unknown function  50.47 
 
 
117 aa  97.1  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2126  membrane protein of unknown function  45.37 
 
 
116 aa  96.7  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2873  membrane protein of unknown function  53.92 
 
 
119 aa  93.6  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0600  membrane protein of unknown function  48.7 
 
 
115 aa  92.8  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2504  hypothetical protein  47.57 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4314  membrane protein of unknown function  46.79 
 
 
110 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181268  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2066  hypothetical protein  49.07 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3258  membrane protein of unknown function  43.12 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.812334  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1444  hypothetical protein  47.06 
 
 
109 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.201338  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1458  hypothetical protein  27.12 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.293367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>