19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0215 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0215  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  258  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1222  hypothetical protein  36.59 
 
 
327 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812835  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1227  hypothetical protein  36.05 
 
 
362 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0397506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4059  putative transposase  47.92 
 
 
332 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4014  putative transposase  47.92 
 
 
332 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.456112  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4072  putative transposase  47.92 
 
 
340 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4028  putative transposase  47.92 
 
 
340 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1224  hypothetical protein  34.83 
 
 
335 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.471371  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1226  hypothetical protein  33.33 
 
 
339 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0790503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  51.06 
 
 
317 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2470  hypothetical protein  42 
 
 
315 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.200487  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1223  hypothetical protein  32.26 
 
 
339 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1225  hypothetical protein  32.26 
 
 
339 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0829025 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2677  hypothetical protein  40 
 
 
331 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3141  hypothetical protein  38.46 
 
 
275 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1137  hypothetical protein  40.38 
 
 
256 aa  42  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0296  hypothetical protein  45.24 
 
 
303 aa  41.6  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0337026  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  37.5 
 
 
292 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  42.86 
 
 
284 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>