10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4949 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4949    100 
 
 		 543 bp  1076    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4496  DNA polymerase III, alpha subunit  89.29 
 
 		 3228 bp  63.9  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964877  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1733  error-prone DNA polymerase  90 
 
 		 3339 bp  60  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.647587  hitchhiker  0.00382273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2732  hypothetical protein  96.77 
 
 		 414 bp  54  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0127287  normal  0.0551467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3765  DNA polymerase III, alpha subunit  88 
 
 		 3264 bp  52  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3147  DNA polymerase III, alpha subunit  94.12 
 
 		 3180 bp  52  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0808  DNA polymerase III, alpha subunit  94.12 
 
 		 3180 bp  52  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.881912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5603  DNA polymerase III, alpha subunit  81.19 
 
 		 3300 bp  50.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00446711 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2860  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  83.82 
 
 		 1230 bp  48.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2987  error-prone DNA polymerase  85 
 
 		 3591 bp  48.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>