10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2879 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2879  hypothetical protein  100 
 
 		 591 aa  1138    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2874  hypothetical protein  37.91 
 
 		 602 aa  282  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266128 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2863  hypothetical protein  35.89 
 
 		 612 aa  280  4e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.440889 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3096  hypothetical protein  32.44 
 
 		 594 aa  161  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0375  hypothetical protein  33.88 
 
 		 604 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639876  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0147  hypothetical protein  30.17 
 
 		 625 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4547  hypothetical protein  28.17 
 
 		 622 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.582266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2235  hypothetical protein  36.97 
 
 		 602 aa  125  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4282  hypothetical protein  27.51 
 
 		 613 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2547  hypothetical protein  27.15 
 
 		 592 aa  63.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>