33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38230 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38230  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  276  7e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6915  hypothetical protein  69.7 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4634  hypothetical protein  64.39 
 
 		 138 aa  170  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.35504  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0390  hypothetical protein  59.09 
 
 		 140 aa  160  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0177  hypothetical protein  58.33 
 
 		 146 aa  157  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10365  hypothetical protein  62.22 
 
 		 145 aa  154  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.548031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4121  hypothetical protein  61.59 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.030665  normal  0.854224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0505  hypothetical protein  63.43 
 
 		 151 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0516  hypothetical protein  63.43 
 
 		 151 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0494  hypothetical protein  63.43 
 
 		 151 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5140  hypothetical protein  57.36 
 
 		 135 aa  143  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02110  hypothetical protein  54.69 
 
 		 147 aa  142  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4781  hypothetical protein  66.92 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4061  hypothetical protein  59.72 
 
 		 146 aa  140  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.556763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0659  hypothetical protein  53.08 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6396  hypothetical protein  59.26 
 
 		 135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3011  hypothetical protein  65.65 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.545636  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08910  hypothetical protein  57.25 
 
 		 141 aa  138  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.249276  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0519  hypothetical protein  50.77 
 
 		 140 aa  137  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0514  hypothetical protein  59.56 
 
 		 139 aa  135  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.613231  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0212  hypothetical protein  61.19 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0131  hypothetical protein  61.76 
 
 		 163 aa  133  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.703605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0672  hypothetical protein  60.15 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0204  hypothetical protein  62.96 
 
 		 139 aa  130  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0232  hypothetical protein  61.19 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0136  hypothetical protein  61.03 
 
 		 142 aa  130  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260123  decreased coverage  0.0000229934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6133  hypothetical protein  63.24 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210257 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4367  hypothetical protein  60.9 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05660  hypothetical protein  60 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.364936  normal  0.47448 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35170  hypothetical protein  57.6 
 
 		 149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4348  hypothetical protein  53.66 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.858908  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2964  hypothetical protein  53.9 
 
 		 138 aa  107  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.220708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3636  putative cytoplasmic protein  54.01 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.400267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>