33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6915 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6915  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  275  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38230  hypothetical protein  69.7 
 
 
137 aa  169  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451635  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0177  hypothetical protein  58.33 
 
 
146 aa  150  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10365  hypothetical protein  59.12 
 
 
145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.548031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0672  hypothetical protein  62.77 
 
 
138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432116  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02110  hypothetical protein  55.64 
 
 
147 aa  145  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4634  hypothetical protein  55.88 
 
 
138 aa  144  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.35504  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0519  hypothetical protein  52.63 
 
 
140 aa  141  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0390  hypothetical protein  54.89 
 
 
140 aa  140  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4061  hypothetical protein  56.55 
 
 
146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.556763  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0232  hypothetical protein  62.77 
 
 
141 aa  138  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43375  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0505  hypothetical protein  59.85 
 
 
151 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0516  hypothetical protein  59.85 
 
 
151 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0494  hypothetical protein  59.85 
 
 
151 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0659  hypothetical protein  51.88 
 
 
139 aa  136  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5140  hypothetical protein  57.69 
 
 
135 aa  135  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0212  hypothetical protein  61.48 
 
 
142 aa  134  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4121  hypothetical protein  56.34 
 
 
145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.030665  normal  0.854224 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0514  hypothetical protein  58.39 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.613231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35170  hypothetical protein  58.52 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4348  hypothetical protein  56.59 
 
 
160 aa  130  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.858908  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6396  hypothetical protein  60 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4781  hypothetical protein  61.11 
 
 
135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3011  hypothetical protein  58.82 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.545636  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05660  hypothetical protein  62.4 
 
 
149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.364936  normal  0.47448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0204  hypothetical protein  58.82 
 
 
139 aa  124  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4367  hypothetical protein  60.15 
 
 
154 aa  124  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0131  hypothetical protein  58.27 
 
 
163 aa  123  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.703605  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0136  hypothetical protein  57.78 
 
 
142 aa  120  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260123  decreased coverage  0.0000229934 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2964  hypothetical protein  61.36 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.220708  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6133  hypothetical protein  57.46 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210257 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08910  hypothetical protein  51.56 
 
 
141 aa  115  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.249276  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3636  putative cytoplasmic protein  55.03 
 
 
153 aa  99  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.400267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>