33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35170 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35170  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  293  7e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5140  hypothetical protein  59.06 
 
 		 135 aa  143  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6915  hypothetical protein  57.66 
 
 		 137 aa  141  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0177  hypothetical protein  56.52 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2964  hypothetical protein  66.42 
 
 		 138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.220708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0390  hypothetical protein  58.02 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4634  hypothetical protein  56.15 
 
 		 138 aa  130  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.35504  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0519  hypothetical protein  53.44 
 
 		 140 aa  130  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0659  hypothetical protein  53.44 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08910  hypothetical protein  56.45 
 
 		 141 aa  127  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.249276  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02110  hypothetical protein  52.71 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10365  hypothetical protein  53.62 
 
 		 145 aa  125  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.548031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6396  hypothetical protein  53.38 
 
 		 135 aa  120  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38230  hypothetical protein  57.6 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4121  hypothetical protein  56.82 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.030665  normal  0.854224 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05660  hypothetical protein  60.68 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.364936  normal  0.47448 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0514  hypothetical protein  56.8 
 
 		 139 aa  117  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.613231  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4061  hypothetical protein  52.55 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.556763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0204  hypothetical protein  55.56 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4348  hypothetical protein  48.92 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.858908  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0672  hypothetical protein  55.15 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0212  hypothetical protein  53.62 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4367  hypothetical protein  57.78 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3636  putative cytoplasmic protein  56.52 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.400267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0131  hypothetical protein  65.82 
 
 		 163 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.703605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0136  hypothetical protein  51.08 
 
 		 142 aa  106  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260123  decreased coverage  0.0000229934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6133  hypothetical protein  68.75 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4781  hypothetical protein  53.68 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0232  hypothetical protein  52.17 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0494  hypothetical protein  54.07 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0516  hypothetical protein  54.07 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0505  hypothetical protein  54.07 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3011  hypothetical protein  56.49 
 
 		 138 aa  98.6  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.545636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>