23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19130 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_19130  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  100 
 
 		 238 aa  475  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0088577  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2272  hypothetical protein  31.71 
 
 		 326 aa  78.6  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.506814  normal  0.0274193 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2125  hypothetical protein  29.88 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556909  normal  0.0145373 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1862  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  43.75 
 
 		 99 aa  64.3  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.731074  normal  0.634573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0862  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase (PHS)  34.74 
 
 		 99 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1815  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.36 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31220  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  39.13 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12116  normal  0.529511 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3867  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.05 
 
 		 99 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1547  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.1 
 
 		 94 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1071  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.63 
 
 		 100 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0179727  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2199  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.33 
 
 		 94 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4119  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.83 
 
 		 94 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.619086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4044  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.83 
 
 		 94 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569471  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2839  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.04 
 
 		 104 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4273  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.71 
 
 		 94 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.748424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.1 
 
 		 102 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1826  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.7 
 
 		 104 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7703  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.44 
 
 		 96 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0648  Protein of unknown function DUF2267  28.89 
 
 		 136 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270306  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0192  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.71 
 
 		 93 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109054  decreased coverage  0.00158686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0745  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.58 
 
 		 97 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4347  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.58 
 
 		 93 aa  42.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.821265  normal  0.581747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2684  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.5 
 
 		 89 aa  42.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.819966  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>