9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2663 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0300    98.13 
 
 
2216 bp  2258    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0356    98.13 
 
 
3581 bp  2258    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0798    100 
 
 
3074 bp  2438    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2433    98.13 
 
 
3378 bp  2258    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.256001  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2654    98.46 
 
 
3355 bp  2290    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00355467  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2663    100 
 
 
2309 bp  4577    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2815    100 
 
 
1813 bp  2438    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1445  integral membrane protein, putative  100 
 
 
1482 bp  54  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.431426  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0801  hypothetical protein  78.57 
 
 
993 bp  52  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>