20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2433 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0356    100 
 
 
3581 bp  2454    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0798    98.13 
 
 
3074 bp  2258    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2815    98.14 
 
 
1813 bp  2266    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1494    96.43 
 
 
2103 bp  1939    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2663    98.13 
 
 
2309 bp  2258    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2158    95.9 
 
 
1963 bp  1901    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0300    100 
 
 
2216 bp  2450    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2433    100 
 
 
3378 bp  6696    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.256001  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2654    98.54 
 
 
3355 bp  2302    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00355467  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2604    96.61 
 
 
2449 bp  1968    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.513462  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2651    97.47 
 
 
2417 bp  2046    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2460  MULE transposase, conserved domain protein  93.79 
 
 
1029 bp  622  1e-175  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0652    92.12 
 
 
849 bp  567  1.0000000000000001e-159  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  98.18 
 
 
303 bp  101  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2241    88.64 
 
 
288 bp  91.7  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2263    100 
 
 
183 bp  79.8  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2501    100 
 
 
258 bp  79.8  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2200    83.18 
 
 
1065 bp  69.9  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000386688 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2133  MULE transposase, conserved domain protein  80.24 
 
 
1083 bp  65.9  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1445  integral membrane protein, putative  100 
 
 
1482 bp  54  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.431426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>