9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1430 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1430  conserved hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  450  1e-125  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2179  hypothetical protein  68.45 
 
 
211 aa  293  2e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54958  hitchhiker  0.000254205 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1695  Snf7  62.38 
 
 
221 aa  262  3e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1866  conserved hypothetical protein  69.31 
 
 
221 aa  256  2e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0061  hypothetical protein  37.19 
 
 
216 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1891  conserved hypothetical protein  39.29 
 
 
259 aa  124  9e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.522365  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0029  hypothetical protein  35.64 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0816  SNF7 protein  35.03 
 
 
216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.283391 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1671  hypothetical protein  34.48 
 
 
270 aa  107  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000972701  normal  0.698741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>