9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1671 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1671  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  530  1e-150  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000972701  normal  0.698741 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1891  conserved hypothetical protein  53.33 
 
 
259 aa  266  2e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.522365  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2179  hypothetical protein  35.63 
 
 
211 aa  113  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54958  hitchhiker  0.000254205 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1430  conserved hypothetical protein  34.48 
 
 
223 aa  107  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1695  Snf7  34.83 
 
 
221 aa  102  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0061  hypothetical protein  31.61 
 
 
216 aa  99.8  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1866  conserved hypothetical protein  35.06 
 
 
221 aa  97.4  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0816  SNF7 protein  25.71 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.283391 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0029  hypothetical protein  26.28 
 
 
215 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>