17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4245 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4245  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000472538 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3220  hypothetical protein  49.01 
 
 		 162 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000447728 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3886  hypothetical protein  46.45 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3560  hypothetical protein  47.97 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00293  hypothetical protein  46.98 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0728  hypothetical protein  47.73 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198898  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0499  hypothetical protein  37.69 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2814  hypothetical protein  38.46 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0147  hypothetical protein  38.17 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2941  hypothetical protein  36.43 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1073  hypothetical protein  36.72 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.440482  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1339  hypothetical protein  42.73 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0070  hypothetical protein  38.17 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2061  hypothetical protein  37.12 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0073  hypothetical protein  36.15 
 
 		 153 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1691  hypothetical protein  33.08 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1844  hypothetical protein  31.78 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>