17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3886 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3886  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  313  7e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3220  hypothetical protein  94.19 
 
 		 162 aa  299  9e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000447728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3560  hypothetical protein  69.03 
 
 		 168 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00293  hypothetical protein  62.76 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0728  hypothetical protein  56.95 
 
 		 158 aa  167  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198898  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4245  hypothetical protein  46.45 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000472538 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0499  hypothetical protein  33.58 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0147  hypothetical protein  35.34 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2814  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2061  hypothetical protein  34.81 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1073  hypothetical protein  29.37 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.440482  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1339  hypothetical protein  39.62 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0070  hypothetical protein  35.34 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0073  hypothetical protein  34.59 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1691  hypothetical protein  31.58 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2941  hypothetical protein  29.69 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1844  hypothetical protein  25.36 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>