16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2425 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2425  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000867114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2181  hypothetical protein  87.5 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000881606  normal  0.0380637 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1855  hypothetical protein  56.47 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000389519  unclonable  0.00000199628 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1638  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106951  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1984  hypothetical protein  55.7 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2135  hypothetical protein  78.38 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2376  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000217298  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1983  hypothetical protein  48.68 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000137823  hitchhiker  0.000000000851334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2364  hypothetical protein  48.68 
 
 		 80 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00105863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2479  hypothetical protein  47.5 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000167852  decreased coverage  0.0000699142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2479  hypothetical protein  55.56 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1758  hypothetical protein  65.31 
 
 		 77 aa  42.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348968  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1850  hypothetical protein  71.43 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00168413  hitchhiker  0.000002493 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2128  hypothetical protein  71.43 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.137783  hitchhiker  0.000222797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1905  hypothetical protein  71.43 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000255556  unclonable  0.0000000000549091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2128  hypothetical protein  75 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.349967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>