24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1896 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1896  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.37242  hitchhiker  0.000312013 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0086  hypothetical protein  68.66 
 
 		 79 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1936  hypothetical protein  68.18 
 
 		 71 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.191302  hitchhiker  0.00184495 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6741  hypothetical protein  61.76 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.612072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4795  hypothetical protein  64.06 
 
 		 73 aa  93.6  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7031  hypothetical protein  62.5 
 
 		 73 aa  93.6  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66358  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3761  hypothetical protein  63.77 
 
 		 74 aa  93.6  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0323703 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0855  hypothetical protein  61.43 
 
 		 72 aa  93.6  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1753  hypothetical protein  60 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0112  hypothetical protein  61.43 
 
 		 70 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.297009  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0097  hypothetical protein  62.12 
 
 		 71 aa  92  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0748733  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2323  hypothetical protein  59.15 
 
 		 74 aa  90.9  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.686412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3090  hypothetical protein  62.12 
 
 		 68 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1092  hypothetical protein  59.15 
 
 		 73 aa  89  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.487472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2272  hypothetical protein  60.94 
 
 		 73 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.509938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6791  hypothetical protein  62.3 
 
 		 70 aa  87.8  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.79564 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1093  hypothetical protein  62.86 
 
 		 75 aa  87.4  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0293  hypothetical protein  62.5 
 
 		 72 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00428454  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3549  hypothetical protein  54.29 
 
 		 79 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00260919  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1855  hypothetical protein  55.38 
 
 		 66 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3538  hypothetical protein  57.97 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4596  hypothetical protein  55.22 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0159  hypothetical protein  48.15 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1590  hypothetical protein  33.87 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>