24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3549 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3549  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  164  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00260919  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0855  hypothetical protein  61.43 
 
 		 72 aa  92.8  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1753  hypothetical protein  52.56 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772918 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1896  hypothetical protein  54.29 
 
 		 70 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.37242  hitchhiker  0.000312013 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0086  hypothetical protein  57.75 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0293  hypothetical protein  55.22 
 
 		 72 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00428454  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2272  hypothetical protein  53.42 
 
 		 73 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.509938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0097  hypothetical protein  53.73 
 
 		 71 aa  77.8  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0748733  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3761  hypothetical protein  53.62 
 
 		 74 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0323703 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6741  hypothetical protein  60.66 
 
 		 69 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.612072 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1936  hypothetical protein  52.24 
 
 		 71 aa  77.4  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.191302  hitchhiker  0.00184495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3538  hypothetical protein  53.62 
 
 		 70 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2323  hypothetical protein  53.03 
 
 		 74 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.686412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4795  hypothetical protein  55.56 
 
 		 73 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1093  hypothetical protein  57.89 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0112  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.297009  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4596  hypothetical protein  52.86 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3090  hypothetical protein  53.62 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1092  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.487472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7031  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  72  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66358  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6791  hypothetical protein  56.45 
 
 		 70 aa  70.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.79564 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1855  hypothetical protein  52.24 
 
 		 66 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0159  hypothetical protein  51.85 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1590  hypothetical protein  31.15 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>