15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1494 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1494  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.333923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3179  hypothetical protein  59.76 
 
 		 187 aa  208  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.860412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2753  hypothetical protein  55.93 
 
 		 176 aa  198  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1686  hypothetical protein  45.41 
 
 		 225 aa  145  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2633  hypothetical protein  42.94 
 
 		 200 aa  138  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0704726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2566  hypothetical protein  42.94 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2741  hypothetical protein  41.49 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1528  hypothetical protein  38.14 
 
 		 239 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2823  hypothetical protein  38.14 
 
 		 239 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1561  hypothetical protein  38.14 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.296774  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1532  hypothetical protein  38.14 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1717  hypothetical protein  40.11 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2211  putative lipoprotein  31.67 
 
 		 181 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1123  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0967  putative lipoprotein  26.67 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3122  lipoprotein  22.01 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.733672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>