32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4871 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4871  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8703  hypothetical protein  67.79 
 
 
213 aa  274  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.265431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4815  hypothetical protein  52.15 
 
 
209 aa  177  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640334  normal  0.0869756 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2663  protein of unknown function DUF1121  36.46 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2285  hypothetical protein  31.77 
 
 
223 aa  103  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1542  protein of unknown function DUF1121  30.24 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2382  protein of unknown function DUF1121  28.16 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0796  hypothetical protein  31.65 
 
 
215 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.160214  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2126  protein of unknown function DUF1121  27.95 
 
 
216 aa  59.3  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.901834 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0773  hypothetical protein  31.01 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00386698  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1347  hypothetical protein  27.88 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0720312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13570  Protein of unknown function (DUF1121)  25.13 
 
 
213 aa  55.1  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0598  protein of unknown function DUF1121  31.69 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0911  hypothetical protein  27.71 
 
 
213 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.849271  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2470  protein of unknown function DUF1121  23.08 
 
 
212 aa  51.6  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1094  hypothetical protein  25.24 
 
 
217 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0236  hypothetical protein  28.74 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000188385  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1232  hypothetical protein  23.94 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1893  protein of unknown function DUF1121  25.12 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2929  hypothetical protein  24.48 
 
 
213 aa  49.3  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0025  protein of unknown function DUF1121  26.14 
 
 
228 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0228107 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2612  hypothetical protein  24.48 
 
 
213 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21950  Protein of unknown function (DUF1121)  29.46 
 
 
211 aa  48.9  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2993  protein of unknown function DUF1121  25.97 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.665625  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2935  protein of unknown function DUF1121  25.9 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3273  hypothetical protein  25.67 
 
 
212 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000862286  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1837  protein of unknown function DUF1121  35.82 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1208  hypothetical protein  26.14 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0486  hypothetical protein  22.73 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1305  protein of unknown function DUF1121  21.71 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1422  hypothetical protein  22.73 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0835369  normal  0.792436 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4126  hypothetical protein  24.85 
 
 
217 aa  41.6  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>