49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2612 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2929  hypothetical protein  99.53 
 
 
213 aa  433  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2612  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  434  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13570  Protein of unknown function (DUF1121)  51.17 
 
 
213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1905  hypothetical protein  49.77 
 
 
213 aa  226  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0446817  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2993  protein of unknown function DUF1121  51.34 
 
 
224 aa  221  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.665625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0096  protein of unknown function DUF1121  46.27 
 
 
205 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1893  protein of unknown function DUF1121  45.54 
 
 
213 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2470  protein of unknown function DUF1121  45.54 
 
 
212 aa  192  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0796  hypothetical protein  42.79 
 
 
215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.160214  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0773  hypothetical protein  42.79 
 
 
215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00386698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2382  protein of unknown function DUF1121  41.12 
 
 
212 aa  166  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1542  protein of unknown function DUF1121  40.58 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3273  hypothetical protein  41 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000862286  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1208  hypothetical protein  43.75 
 
 
213 aa  160  9e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0958  protein of unknown function DUF1121  38.94 
 
 
213 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155501  decreased coverage  0.000000000358592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21950  Protein of unknown function (DUF1121)  41.71 
 
 
211 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3772  protein of unknown function DUF1121  38.65 
 
 
217 aa  157  9e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.602543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3856  protein of unknown function DUF1121  38.16 
 
 
217 aa  156  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00447083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3334  hypothetical protein  38.1 
 
 
217 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0125  hypothetical protein  40.28 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.776517  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1094  hypothetical protein  38.35 
 
 
217 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2126  protein of unknown function DUF1121  38.24 
 
 
216 aa  149  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.901834 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0025  protein of unknown function DUF1121  39.32 
 
 
228 aa  147  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0228107 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0762  hypothetical protein  39.5 
 
 
217 aa  146  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4126  hypothetical protein  35.75 
 
 
217 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2921  protein of unknown function DUF1121  37.2 
 
 
216 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.257573 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0911  hypothetical protein  37.5 
 
 
213 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.849271  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0424  hypothetical protein  42.51 
 
 
213 aa  144  9e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2935  protein of unknown function DUF1121  35.75 
 
 
217 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1212  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  141  6e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1837  protein of unknown function DUF1121  34.98 
 
 
219 aa  141  8e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0236  hypothetical protein  34.72 
 
 
217 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000188385  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1232  hypothetical protein  33.5 
 
 
217 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1422  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  136  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0835369  normal  0.792436 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0486  hypothetical protein  32.37 
 
 
213 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1347  hypothetical protein  38.24 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0720312  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2335  hypothetical protein  33.5 
 
 
227 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0478428  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1410  hypothetical protein  34.3 
 
 
213 aa  132  5e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.836587  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1793  protein of unknown function DUF1121  38.1 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3138  protein of unknown function DUF1121  33.02 
 
 
209 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0598  protein of unknown function DUF1121  34.43 
 
 
214 aa  121  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1287  protein of unknown function DUF1121  40.74 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1305  protein of unknown function DUF1121  41.22 
 
 
203 aa  111  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0753  protein of unknown function DUF1121  33.94 
 
 
198 aa  100  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2285  hypothetical protein  25.35 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2663  protein of unknown function DUF1121  23.94 
 
 
218 aa  64.7  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4815  hypothetical protein  28.38 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640334  normal  0.0869756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8703  hypothetical protein  25.12 
 
 
213 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.265431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4871  hypothetical protein  23.73 
 
 
209 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0163871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>