31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2379 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2379  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  342  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0281  hypothetical protein  43.67 
 
 
168 aa  121  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0437865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0324  hypothetical protein  42.6 
 
 
168 aa  120  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3604  protein of unknown function DUF402  48.47 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0611051  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1004  hypothetical protein  43.03 
 
 
198 aa  114  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3701  hypothetical protein  38.75 
 
 
167 aa  97.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1639  hypothetical protein  37.27 
 
 
194 aa  90.9  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000840175 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1646  hypothetical protein  36.97 
 
 
186 aa  85.5  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2386  hypothetical protein  33.11 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125037  hitchhiker  0.00068546 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1921  hypothetical protein  26.09 
 
 
180 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1955  hypothetical protein  26.09 
 
 
180 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1405  hypothetical protein  25.47 
 
 
180 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0582  hypothetical protein  25.61 
 
 
176 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0438  hypothetical protein  25.61 
 
 
176 aa  50.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0941182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0434  hypothetical protein  25.61 
 
 
176 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0510  hypothetical protein  25.61 
 
 
176 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0583  hypothetical protein  25.61 
 
 
176 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0411  hypothetical protein  25.75 
 
 
177 aa  50.8  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4794  hypothetical protein  25.61 
 
 
176 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0271924  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0443  hypothetical protein  25.61 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0531  hypothetical protein  25.61 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.408339  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0527  hypothetical protein  25 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0495  hypothetical protein  25 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1696  hypothetical protein  24.85 
 
 
184 aa  48.5  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0673  hypothetical protein  24.85 
 
 
189 aa  48.1  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.413184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1350  hypothetical protein  23.12 
 
 
178 aa  47.8  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0474  hypothetical protein  22.29 
 
 
177 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00172302  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0449  hypothetical protein  24.38 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0421  hypothetical protein  25.15 
 
 
177 aa  44.3  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1055  hypothetical protein  25.32 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195641  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1369  hypothetical protein  22.88 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000291159  hitchhiker  0.0000000113802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>