17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0281 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0281  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  342  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0324  hypothetical protein  92.86 
 
 		 168 aa  320  4e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2379  hypothetical protein  44.76 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3604  protein of unknown function DUF402  42.51 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0611051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3701  hypothetical protein  38.51 
 
 		 167 aa  87.4  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134012  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1004  hypothetical protein  38.46 
 
 		 198 aa  87  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1646  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8191  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1639  hypothetical protein  31.95 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000840175 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0673  hypothetical protein  25.95 
 
 		 189 aa  51.2  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.413184  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0411  hypothetical protein  25.79 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1369  hypothetical protein  23.27 
 
 		 204 aa  48.5  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000291159  hitchhiker  0.0000000113802 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1055  hypothetical protein  24.22 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195641  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0421  hypothetical protein  24.68 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1696  hypothetical protein  23.42 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0474  hypothetical protein  22.78 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00172302  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1350  hypothetical protein  25.62 
 
 		 178 aa  42  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1405  hypothetical protein  23.12 
 
 		 180 aa  40.8  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>