28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1968 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1968  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  249  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1065  hypothetical protein  63.25 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1957  hypothetical protein  62.1 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127418  hitchhiker  0.00000331602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1590  hypothetical protein  58.87 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.500366  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0087  hypothetical protein  57.5 
 
 		 125 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.193229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3367  hypothetical protein  61.95 
 
 		 133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00403112  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2530  hypothetical protein  53.6 
 
 		 136 aa  130  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5503  hypothetical protein  56.45 
 
 		 132 aa  130  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125578  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1550  hypothetical protein  54.47 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.3108  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3618  hypothetical protein  55.37 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0549643  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3515  hypothetical protein  50.41 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6309  hypothetical protein  48.78 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2150  hypothetical protein  43.9 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000252745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2277  hypothetical protein  45.97 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0147  hypothetical protein  48.8 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.416427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2347  hypothetical protein  50.83 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2155  hypothetical protein  56.45 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1634  hypothetical protein  45.9 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1723  hypothetical protein  55.65 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1121  hypothetical protein  45.6 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.705516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1794  hypothetical protein  55.65 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3203  hypothetical protein  47.5 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00257301  normal  0.651911 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2572  hypothetical protein  44.63 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2565  hypothetical protein  38.89 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1809  hypothetical protein  43.09 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13590  hypothetical protein  43.44 
 
 		 162 aa  84.3  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.486672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1135  hypothetical protein  29.27 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0323  hypothetical protein  23.97 
 
 		 271 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>